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If you use these results in your work, please cite: Hanson-Smith and Johnson, PLoS Comp. Bio., 2016


Overview | Alignments | Sites | Trees | Ancestors | Mutations


Select an Alignment:

Select a Site:

Site 3310 in Alignment 'msaprobs'


Similarity to Other Alignments

What percentage of the residues at this site are inferred to be a single site (i.e. homologous) in the alignments produced by other methods? A value of 100% indicates that the existence of site 3310 is robust across multiple methods. Values less than 100% indicate that other alignment methods made different homology inferences.

Similarity of Site 3310 in 'msaprobs'
to Sites in 'muscle'

What percentage of the residues at this site in msaprobs are inferred to be a single site (i.e. homologous) in the alignments produced by muscle? A value of 100% indicates that the existence of site 3310 is reproduced using the muscle method. Values less than 100% indicate that muscle made different homology inferences for the residues at this site.


Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Schizosaccharomyces.octosporus.IME2 ---ACL--E- L -DF--F---V Site 2076
Dictyostelium.discoideum.SKY1..sp.Q86A12.SKY1_DICD ---DCL--N- H -TW--L---K Site 2076
Danio.rerio.CDK1 ---NAL--V- H -RF--F---R Site 2076
Medicago.sativa.MAPK3..sp.Q07176.MMK1_MEDSA.Mitoge ---DAL--A- H -PY--L---T Site 2076
Xenopus.laevis.CDK5..sp.P51166.CDK5_XENLA.Cyclin.d ---EAL--Q- H -PY--F---A Site 2076
Oikopleura.dioica.CDK5..tr.J9JF51.J9JF51_OIKDI.CDK ---QAL--M- H -QY--F---T Site 2076
Candida.guilliermondii.IME2 ---ELY--D- Q -SY--F---M Site 2076
Zea.mays.CK1a..gi.413939414.gb.AFW73965.1..putativ GSRPSS--T- Q -RVNPSPGEA Site 2688
Chlamydomonas.reinhardtii.LF4 ---QAL--R- H -PY--F---R Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.GSK3.1..Protein.kinase.g ---EVL--T- H -PF--F---D Site 2076
Drosophila.melanogaster.CK1c...gi.7292798.gb.AAF48 ILFRTL--N- H -QYDYIYDWT Site 2037
Saccharmomyces.cerevisiae.CK1..gi.433622.emb.CAA42 KQFANT--G- A -NGQTNKYPY Site 2693
Homo.sapiens.CDK8..Cyclin.dependent.kinase.8.OS.Ho ---QAM--Q- D -PY--F---L Site 2076
Schizosaccharomyces.octosporus.b.IME2 ---SCK---- E -KY--F---P Site 2074
Candida.albicans.MAPK3..Extracellular.signal.regul ---DAL--K- H -PY--L---Q Site 2076
Arabidopsis.thaliana.CK2a2..sp.Q08466.CSK22_ARATH. ---EAM--A- H -PY--F---A Site 2076
Galdieria.suphuraria.CK1..gi.545709990.ref.XP_0057 ETSRRM--L- G -EGGVDTLKD Site 2485
Suberites.domuncula.JNK..Stress.activated.protein. ---QAL--A- H -PY--V---S Site 2076
Homo.sapiens.CLK3..Dual.specificity.protein.kinase ---EAL--L- H -PF--F---A Site 2076
Aedes.aegypti.CDK1 ---KIL--E- H -KY--F---- Site 2076
Mus.musculus.CLK1..sp.P22518.CLK1_MOUSE.Dual.speci ---EAL--K- H -PF--F---Y Site 2076
Homo.sapiens.CLK2..Dual.specificity.protein.kinase ---EAL--Q- H -PF--F---A Site 2076
Homo.sapiens.DYRK4..Dual.specificity.tyrosine.phos ---QAL--K- H -AW--I---H Site 2076
Homo.sapiens.HIPK1..Homeodomain.interacting.protei ---KTL--N- H -QF--V---T Site 2076
Gallus.gallus.CDKL1..tr.E1C5K5.E1C5K5_CHICK.Unchar ---QLL--Q- H -PY--F---D Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Nosema.ceranae.CDK1 ---QAL--N- H -KF--F---E Site 2076
Homo.sapiens.CSK2a2..sp.P19784.CSK22_HUMAN.Casein. ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Drosophila.melanogaster.MAPK3..sp.P40417.ERKA_DROM ---EAL--A- H -PY--L---E Site 2076
Strongylocentrotus.purpuratus.CDK1 ---TGL--S- H -PY--F---K Site 2076
Zea.mays.CK1b..gi.226502995.ref.NP_001148106.1..ca LGVSAS--H- N -NVLLQSTSL Site 2485
Drosophila.melanogaster.CDK1 ---DIL--E- H -PY--F---N Site 2076
Oxytricha.trifallax.CK..gi.403365855.gb.EJY82718.1 PNIAKQ--N- S -NSNTRVNSQ Site 2698
Dictyostelium.discoideum.CK1..sp.Q556Y4.KC1_DICDI. STPSYN--N- V -DSDQSPQQT Site 2513
Arabidopsis.thaliana.SRPK1..tr.Q9FYB4.Q9FYB4_ARATH ---QCL--D- H -PW--M---N Site 2076
Homo.sapiens.CDK18..sp.Q07002.CDK18_HUMAN.Cyclin.d ---AAL--S- H -SY--F---R Site 2076
Crassostrea.gigas.PFTAIRE..tr.K1Q2C8.K1Q2C8_CRAGI. ---QAL--H- H -EY--F---G Site 2076
Tetradon.nigroviridis.MAPK10..tr.H3CCC1.H3CCC1_TET ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Homo.sapiens.CDKL2..Cyclin.dependent.kinase.like.2 ---ELL--H- H -DF--F---Q Site 2076
Takifugu.rubripes.MAPK10..tr.H2U861.H2U861_TAKRU.U ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Homo.sapiens.MAPK13..sp.O15264.MK13_HUMAN.Mitogen. ---QAL--T- H -PF--F---E Site 2076
Homo.sapiens.NLK..sp.Q9UBE8.NLK_HUMAN.Serine.threo ---DAL--A- H -PY--L---D Site 2076
Bombus.terrestris.CDK1 ---KGL--S- H -PY--F---T Site 2076
Homo.sapiens.SRSF.GN.SRPK1.PE.1.SV.2 ---ECL--R- H -PW--L---N Site 2076
Gallus.gallus.CDKL2..tr.E1C431.E1C431_CHICK.Unchar ---ELL--Q- S -DF--F---N Site 2076
Xenopus.laevis.MAPK8.sp.Q8QHK8.MK08_XENLA.Mitogen. ---DAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Homo.sapiens.CDK12..sp.Q9NYV4.CDK12_HUMAN.Cyclin.d ---QTL--Q- S -DF--L---K Site 2076
Mus.musculus.MOK..MAPK.MAK.MRK.overlapping.kinase. ---QAL--Q- H -PY--F---Q Site 2076
Trypanosoma.brucei.GSK3..Glycogen.synthase.kinase. ---DAL--C- H -PF--F---N Site 2076
Leishmania.infantum.GSK3..tr.A4HXQ3.A4HXQ3_LEIIN.G ---EAL--C- H -PY--F---D Site 2076
Drosophila.melanogaster.CK1a...gi.22832152.gb.AAN0 ILFRTL--N- H -QYDYIYDWT Site 2037
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Arabidopsis.thaliana.CK1..gi.332659757.gb.AEE85157 EELLQR--S- R -TGDVSRGVI Site 2673
Drosophila.melanogaster.HIPK..tr.M9PDR2.M9PDR2_DRO ---EAL--N- H -SF--T---R Site 2076
Arabidopsis.thaliana.CK2a..sp.Q08467.CSK21_ARATH.C ---EAM--A- H -AY--F---A Site 2076
Xenopus.tropicalis.NLK1..tr.B0JZD9.B0JZD9_XENTR.Nl ---DAL--A- H -PY--L---D Site 2076
Homo.sapiens.CDKL1..Cyclin.dependent.kinase.like.1 ---QLL--H- H -PY--F---E Site 2076
Homo.sapiens.HIPK3..Homeodomain.interacting.protei ---ETL--N- H -PF--V---N Site 2076
Homo.sapiens.CDK11A..Cyclin.dependent.kinase.11A.O ---DGL--K- H -EY--F---R Site 2076
Danio.rerio.CDKL5..tr.B9X2H6.B9X2H6_DANRE.Cyclin.d ---QCL--N- H -PV--F---Q Site 2076
Mus.musculus.CLK2..sp.O35491.CLK2_MOUSE.Dual.speci ---EAL--Q- H -PF--F---A Site 2076
Homo.sapiens.CDK11B..Cyclin.dependent.kinase.11B.O ---DGL--K- H -EY--F---R Site 2076
Naegleria.gruberi.LF4 ---KAL--R- H -PY--F---K Site 2076
Saccharomyces.bayanus.IME2 ---ELC--E- M -PF--F---E Site 2076
Mus.musculus.CSK2a2..sp.O54833.CSK22_MOUSE.Casein. ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Danio.rerio.MAPK12..sp.O42376.MK12_DANRE.Mitogen.a ---EAL--A- F -PF--F---S Site 2076
Dictyostelium.discoideum.CDK7..Cyclin.dependent.ki ---DAL--N- H -PY--F---T Site 2076
Dictyostelium.discoideum.DYRK1..Probable.serine.th ---EAL--Q- H -SF--F---L Site 2076
Mus.musculus.DYR1B..Dual.specificity.tyrosine.phos ---GAL--Q- H -GF--F---R Site 2076
Homo.sapiens.DYRK2..Dual.specificity.tyrosine.phos ---QAL--R- H -PW--L---R Site 2076
Mus.musculus.CDKL5..sp.Q3UTQ8.CDKL5_MOUSE.Cyclin.d ---QCL--N- H -PT--F---Q Site 2076
Mus.musculus.MAPK15.sp.Q80Y86.MK15_MOUSE.Mitogen.a ---QAL--Q- H -PY--V---Q Site 2076
Danio.rerio.TTK..sp.Q8AYG3.TTK_DANRE.Dual.specific ---ELL--D- H -PY--L---Q Site 2076
Mus.musculus.DYRK4..Dual.specificity.tyrosine.phos ---QAL--K- H -AW--I---H Site 2076
Aspergillus.nidulans.IME2 ---QAM--Q- H -EY--F---A Site 2076
Mus.musculus.CDC7...sp.Q9Z0H0.CDC7_MOUSE.Cell.divi ---AAL--L- H -AF--F---K Site 2076
Caenorhabditis.elegans.NLK..sp.Q9U9Y8.NLK_CAEEL.Se ---EAL--Q- H -RY--L---E Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Mus.musculus.MAK..Serine.threonine.protein.kinase. ---QAL--K- H -PY--F---Q Site 2076
Homo.sapiens.CDK2..sp.P24941.CDK2_HUMAN.Cyclin.dep ---AAL--A- H -PF--F---Q Site 2076
Xenopus.tropicalis.MAPK10..tr.F7CYE3.F7CYE3_XENTR. ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Glycine.max.GSK3..tr.C7AE95.C7AE95_SOYBN.Glycogen. ---DAL--T- H -PF--F---D Site 2076
Penicillium.marneffei.IME2 ---QAL--N- H -EY--F---A Site 2076
Danio.rerio.MAPK14b..sp.Q9DGE1.MK14B_DANRE.Mitogen ---QAL--A- H -PY--F---A Site 2076
Homo.sapiens.MAPK4..sp.P31152.MK04_HUMAN.Mitogen.a ---MGL--Q- H -PY--M---S Site 2076
Drosophila.melanogaster.MAK ---QSL--K- Y -PY--F---H Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.PRP4..sp.Q07538.PRP4_SCH ---VAL--K- H -PF--F---I Site 2076
Mus.muculus.PRP4..sp.Q61136.PRP4B_MOUSE.Serine.thr ---QAL--Q- H -AF--I---Q Site 2076
Mus.musculus.CDK12.sp.Q14AX6.CDK12_MOUSE.Cyclin.de ---QTL--Q- S -DF--L---K Site 2076
Dictyostelium.discoideum.CDK8..Probable.cyclin.dep ---EAL--D- H -PY--F---K Site 2076
Mus.musculus.CDK10..sp.Q3UMM4.CDK10_MOUSE.Cyclin.d ---DCL--E- S -SY--F---K Site 2076
Homo.sapiens.MAPK10..Mitogen.activated.protein.kin ---DAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Homo.sapiens.MAPK9..sp.P45984.MK09_HUMAN.Mitogen.a ---EAL--R- H -PY--I---T Site 2076
Homo.sapiens.CLK1..Dual.specificity.protein.kinase ---EAL--K- H -PF--F---D Site 2076
Homo.sapiens.CDC7..sp.O00311.CDC7_HUMAN.Cell.divis ---EAL--L- H -PF--F---K Site 2076
Drosophila.melanogaster.CK1d..gi.272506076.gb.ACZ9 ILFRTL--N- H -QYDYIYDWT Site 2037
Candida.parapsilosis.IME2 ---DLA--C- S -KY--F---S Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.SSN3..Serine.threonine.p ---QAL--E- H -VF--F---T Site 2076
Homo.sapiens.GSK3a..sp.P49840.GSK3A_HUMAN.Glycogen ---EAC--A- H -SF--F---D Site 2076
Gallus.gallus.MAPK9..sp.P79996.MK09_CHICK.Mitogen. ---EAL--R- H -PY--I---T Site 2076
Homo.sapiens.CK2a..sp.P68400.CSK21_HUMAN.Casein.ki ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Taeniopygia.guttata.CLK4..tr.H0YSC9.H0YSC9_TAEGU.U ---EAL--Q- H -PF--F---D Site 2076
Mus.musculus.MAPK4..sp.Q6P5G0.MK04_MOUSE.Mitogen.a ---MGL--Q- H -PY--M---S Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Mus.musculus.CDK16..sp.Q04735.CDK16_MOUSE.Cyclin.d ---DAR--K- H -PF--F---L Site 2076
Homo.sapiens.CSK2a1..sp.P68400.CSK21_HUMAN.Casein. ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Yarrowia.lipolytica.SSN3..Serine.threonine.protein ---DAL--L- H -PY--F---T Site 2076
Xenopus.tropicalis.MAPK13..tr.B1WBJ0.B1WBJ0_XENTR. ---EAL--E- H -PY--F---D Site 2076
Homo.sapiens.DYR1B..Dual.specificity.tyrosine.phos ---GAL--Q- H -GF--F---R Site 2076
Caenorhabditis.elegans.CSK2a..sp.P18334.CSK2A_CAEE ---EAM--G- H -EY--F---R Site 2076
Thalassiosira.pseudonona.GSK3..tr.B8CFP1.B8CFP1_TH ---EGC--A- H -AF--F---D Site 2076
Dictyostelium.discoideum.GSK3..sp.P51136.GSK3_DICD ---EIC--A- H -PF--F---D Site 2076
Candida.orthopsilosis.IME2 ---ELA--C- F -EY--F---S Site 2076
Danio.rerio.CDK7..tr.Q6NWC5.Q6NWC5_DANRE.Cdk7.prot ---QAL--K- M -KY--F---S Site 2076
Ancylostoma.caninum.MAPK8.sp.Q9U6D2.JNK1_ANCCA.Str ---DAL--A- H -EY--V---N Site 2076
Debaryomyces.hansenii.IME2 ---TVC--A- M -SY--F---K Site 2076
Volvos.carteri.GSK3..tr.D8TP98.D8TP98_VOLCA.Putati ---QAM--T- H -PF--F---D Site 2076
Ashbya.gossypii.SSN3..Serine.threonine.protein.kin ---DAL--E- H -EY--F---T Site 2076
Caenorhabditis.briggsae.CDK2..tr.A8XL31.A8XL31_CAE ---GAL--C- H -RY--F---L Site 2076
Caenorhabditis.briggsae.CDK1 ---KAL--H- H -PY--F---N Site 2076
Drosophila.melanogaster.CSK2a..sp.P08181.CSK2A_DRO ---EAM--A- H -PY--F---L Site 2076
Mus.musculus.CDK20.sp.Q9JHU3.CDK20_MOUSE.Cyclin.de ---QAL--L- H -QY--F---F Site 2076
Mus.musculus.DYRK3..Dual.specificity.tyrosine.phos ---QAL--R- H -PW--I---S Site 2076
Gallus.gallus.CDK6..tr.Q90771.Q90771_CHICK.Cyclin. ---AAL--S- H -PY--F---H Site 2076
Monosiga.brevicollis.CDK1 ---VAL--C- H -PY--F---D Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.SKY1 ---GLV--N- H -PW--L---K Site 2076
Komagataella.pastoris.MAPK3..tr.F2QYY4.F2QYY4_PICP ---DAL--R- H -PY--L---Q Site 2076
Petromyzon.marinus.CDKL3..tr.S4RCQ7.S4RCQ7_PETMA.U ---RLL--Q- H -DY--F---T Site 2076
Drosophila.melanogaster.GSK3..Protein.kinase.shagg ---KAC--A- H -PF--F---D Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Plasmodium.falciparum.CK1..sp.Q8IHZ9.KC1_PLAF7.Cas LLKDLF--I- R -EGFTYDFLF Site 2030
Homo.sapiens.MAPK15..sp.Q8TD08.MK15_HUMAN.Mitogen. ---QAL--Q- H -PY--V---Q Site 2076
Mus.musculus.CDKL2..sp.Q9QUK0.CDKL2_MOUSE.Cyclin.d ---DLL--R- H -DF--F---Q Site 2076
Dictyostelium.discoideum.CDK10..Probable.cyclin.de ---DAI--K- H -PF--F---Y Site 2076
Homo.sapiens.CDKL5..sp.O76039.CDKL5_HUMAN.Cyclin.d ---QCL--N- H -PT--F---Q Site 2076
Ajellomyces.capsulatus.CDK1 ---QAC--M- H -PY--F---Q Site 2076
Dictystelium.discoideum.MAPK3..Extracellular.signa ---EAL--A- H -PY--F---Q Site 2076
Homo.sapiens.CDK6..sp.Q00534.CDK6_HUMAN.Cyclin.dep ---SAL--S- H -PY--F---Q Site 2076
Bos.taurus.CDK10..sp.Q2TBL8.CDK10_BOVIN.Cyclin.dep ---DCL--E- S -SY--F---K Site 2076
Homo.sapiens.MAPK8.sp.P45983.MK08_HUMAN.Mitogen.ac ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Mus.musculus.MAPK13..sp.Q9Z1B7.MK13_MOUSE.Mitogen. ---QAL--A- H -PF--F---E Site 2076
Drosophila.melanogaster.CDK4..tr.Q94877.Q94877_DRO ---ACL--E- H -DY--F---Q Site 2076
Xenopus.tropicalis.NLK2..sp.B1H3E1.NLK2_XENTR.Seri ---DAL--A- H -PY--L---E Site 2076
Gallus.gallus.MAPK10..tr.E1C8C5.E1C8C5_CHICK.Uncha ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.CDK1 ---RAA--I- H -PY--F---Q Site 2076
Lodderomyces.elongisporus.IME2 ---QLS--K- M -SY--F---K Site 2076
Danio.rerio.MAPK14a..sp.Q9DGE2.MK14A_DANRE.Mitogen ---EAL--A- H -PY--F---A Site 2076
Xenopus.tropicalis.CLK2..tr.F7C0E3.F7C0E3_XENTR.Un ---AAL--K- H -PF--F---S Site 2076
Gallus.gallus.CDKL5..tr.E1BTX0.E1BTX0_CHICK.Unchar ---QCL--N- H -PS--F---Q Site 2076
Kluyveromyces.lactis.GSK3..tr.O60042.O60042_KLULC. ---QCM--FN S -TY--F---T Site 2076
Drosophila.melanogaster.MAPK15..tr.Q9W354.Q9W354_D ---EAI--R- H -PY--V---S Site 2076
Homo.sapiens.CLK4..Dual.specificity.protein.kinase ---EAL--Q- H -PF--F---D Site 2076
Xenopus.tropicalis.HIPK2..tr.F7A386.F7A386_XENTR.U ---ETL--N- H -PF--V---T Site 2076
Mus.musculus.CDKL1..sp.Q8CEQ0.CDKL1_MOUSE.Cyclin.d ---QLL--Q- H -PY--F---D Site 2076
Mus.musculus.GSK3a..sp.Q2NL51.GSK3A_MOUSE.Glycogen ---EAC--A- H -SF--F---D Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Caenorhabditis.elegans.CDK1 ---KAL--V- H -PY--F---D Site 2076
Homo.sapiens.CDK4..sp.P11802.CDK4_HUMAN.Cyclin.dep ---RAL--Q- H -SY--L---H Site 2076
Cryptococcus.neoformans.SSN3..Serine.threonine.pro ---DAL--R- H -PW--F---Q Site 2076
Salmo.salar.CDK1 ---NAL--V- H -RF--F---R Site 2076
Xenopus.Laevis.CDK7..sp.P20911.CDK7_XENLA.Cyclin.d ---QAL--R- K -RY--F---S Site 2076
Homo.sapiens.CDK20..sp.Q8IZL9.CDK20_HUMAN.Cyclin.d ---KAL--L- H -QY--F---F Site 2076
Homo.sapiens.TTK..sp.P33981.TTK_HUMAN.Dual.specifi ---ELL--A- H -PY--V---Q Site 2076
Mus.musculus.GSK3b..sp.Q9WV60.GSK3B_MOUSE.Glycogen ---EAC--A- H -SF--F---D Site 2076
Homo.sapiens.SGK71..sp.Q8NE28.SGK71_HUMAN.Probable ---DVV--H- I -TF--L---R Site 1885
Aspergillus.fumigatus.IME2 ---DAL--N- H -EY--F---A Site 2076
Danio.rerio.CDK8..Cyclin.dependent.kinase.8.OS.Dan ---QAM--Q- D -PY--F---L Site 2076
Oryzias.latipes.CLK2b.tr.H2M4E3.H2M4E3_ORYLA.Uncha ---SAL--E- H -PF--F---L Site 2076
Gallus.gallus.MAPK13..tr.E1C7W3.E1C7W3_CHICK.Uncha ---EAL--A- H -PY--F---D Site 2076
Caenorhabditis.briggsae.NLK..sp.A8XSC1.NLK_CAEBR.S ---EAL--S- H -PY--L---E Site 2076
Mus.musculus.HIPK2.sp.Q9QZR5.HIPK2_MOUSE.Homeodoma ---ETL--N- H -PF--V---T Site 2076
Homo.sapiens.MAPK3..Mitogen.activated.protein.kina ---EAL--A- H -PY--L---E Site 2076
Mus.musculus.CDK17..sp.Q8K0D0.CDK17_MOUSE.Cyclin.d ---EAM--K- H -VY--F---R Site 2076
Homo.sapiens.CDK10..Cyclin.dependent.kinase.10.OS. ---DCL--E- S -SY--F---K Site 2076
Danio.rerio.CDKL1..sp.Q6AXJ9.CDKL1_DANRE.Cyclin.de ---QLL--E- Q -PY--F---D Site 2076
Drosophila.melanogaster.JNK..sp.P92208.JNK_DROME.S ---EAL--K- H -EY--I---N Site 2076
Petromyzon.marinus.MAPK13..tr.S4RVM7.S4RVM7_PETMA. ---EAL--Q- H -PF--F---S Site 2076
Candida.glabrata.IME2 ---QLS--S- M -PF--F---T Site 2076
Homo.sapiens.MAK..Serine.threonine.protein.kinase. ---QAL--K- H -PY--F---Q Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.IME2 ---MCL--D- L -EF--C---R Site 2076
Scheffersomyces.stipitis.MAPK3..tr.A3GF15.A3GF15_P ---DAL--K- H -PY--L---K Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Glossina.morsitans.CDK5..sp.Q2PQN9.CDK5_GLOMM.Cycl ---QAM--Q- H -PY--F---T Site 2076
Mus.musculus.HIPK4..sp.Q3V016.HIPK4_MOUSE.Homeodom ---AAL--R- H -PF--V---S Site 2076
Homo.sapiens.CK1..gi.68303575.ref.NP_001020276.1.. RTLNHQ--Y- D -YTFDWTMLK Site 2040
Mus.musculus.CDK18..sp.Q04899.CDK18_MOUSE.Cyclin.d ---AAL--N- H -PY--F---Q Site 2076
Mus.musculus.CDKL4..sp.Q3TZA2.CDKL4_MOUSE.Cyclin.d ---QLL--D- S -AY--F---E Site 2076
Branchiostoma.floridae.CDK1 ---AAI--N- H -VY--F---H Site 2076
Gallus.gallus.CLK2..tr.Q5ZJ82.Q5ZJ82_CHICK.Unchara ---EAL--K- H -PF--F---D Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.GSK3..sp.Q10452.GSK3_SCH ---EAM--C- H -PF--F---D Site 2076
Oikopleura.dioica.CDKL2..tr.E4XDC6.E4XDC6_OIKDI.CD ---SLL--T- N SEY--F---L Site 2075
Caenorhabditis.briggsae.GSK3..sp.A8X5H5.GSK3_CAEBR ---AAC--Q- H -AF--F---D Site 2076
Taeniopygia.guttata.CDK10..tr.H0ZC86.H0ZC86_TAEGU. ---------- - ----------  
Homo.sapiens.ICK..Serine.threonine.protein.kinase. ---QAL--R- Y -PY--F---Q Site 2076
Mus.musculus.CLK3..sp.O35492.CLK3_MOUSE.Dual.speci ---EAL--L- H -PF--F---A Site 2076
Mus.musculus.DYR1A..Dual.specificity.tyrosine.phos ---YAL--Q- H -SF--F---K Site 2076
Mus.musculus.CDK2..sp.P97377.CDK2_MOUSE.Cyclin.dep ---AAL--A- H -PF--F---Q Site 2076
Bos.taurus.MAPK7..sp.A5PKJ4.MK07_BOVIN.Mitogen.act ---AAL--R- H -PF--L---A Site 2076
Homo.sapiens.MAPK14..sp.Q16539.MK14_HUMAN.Mitogen. ---QAL--A- H -AY--F---A Site 2076
Lachancea.thermotolerans.SKY1 ---GMV--N- H -PW--L---R Site 2076
Mus.musculus.MAPK6..sp.Q61532.MK06_MOUSE.Mitogen.a ---EAL--S- H -PY--M---S Site 2076
Dictyostelium.discoideum.CDK1 ---EAL--L- H -PY--F---G Site 2076
Mus.musculus.MAPK12..sp.O08911.MK12_MOUSE.Mitogen. ---EAL--T- H -PY--F---E Site 2076
Xenopus.tropicalis.IME2 ---AAL--T- H -AF--F---R Site 2076
Xenopus.tropicalis.HIPK1..tr.F6T404.F6T404_XENTR.U ---KTL--N- H -PF--V---T Site 2076
Gallus.gallus.CSK2a..sp.P21868.CSK21_CHICK.Casein. ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Xenopus.laevis.CDK2..sp.P23437.CDK2_XENLA.Cyclin.d ---VAL--T- H -PF--F---R Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Gallus.gallus.CDK3..tr.F1NA68.F1NA68_CHICK.Unchara ---AAL--S- H -QY--F---F Site 2076
Mus.musculus.CDK15..Cyclin.dependent.kinase.15.OS. ---EAL--V- H -DY--F---S Site 2076
Dictyostelium.discoideum.MAPK1.sp.Q54QB1.ERK2_DICD ---EAL--A- H -PF--V---T Site 2076
Homo.sapiens.DYR1A..Dual.specificity.tyrosine.phos ---YAL--Q- H -SF--F---K Site 2076
Homo.sapiens.GSK3b..sp.P49841.GSK3B_HUMAN.Glycogen ---EAC--A- H -SF--F---D Site 2076
Drosophila.melanogaster.GSK3H..Putative.glycogen.s ---MGC--A- H -PF--F---D Site 2076
Oikopleura.dioica.CDK10..tr.J7PN91.J7PN91_OIKDI.CD ---AAL--K- H -QY--F---K Site 2076
Encephalitozoon.cuniculi.CDK1 ---NGL--S- H -KY--F---E Site 2076
Saccharomyces.kluyveri.IME2 ---QVC--C- M -PY--F---K Site 2076
Mus.musculus.CLK4..sp.O35493.CLK4_MOUSE.Dual.speci ---EAL--Q- H -PF--F---D Site 2076
Homo.sapiens.MAPK1..sp.P28482.MK01_HUMAN.Mitogen.a ---QAL--A- H -PY--L---E Site 2076
Homo.sapiens.CDK15..Cyclin.dependent.kinase.15.OS. ---EAL--V- H -DY--F---S Site 2076
Cryptococcus.neoformans.IME2 ---QCI--D- H -PY--F---H Site 2076
Homo.sapiens.HIPK4..Homeodomain.interacting.protei ---AAL--R- H -PF--V---S Site 2076
Mus.musculus.SRSF.sp.O70551.SRPK1_MOUSE.SRSF.prote ---ECL--R- H -PW--L---N Site 2076
Candida.lusitaniae.IME2 ---ELF--R- S -TY--F---K Site 2076
Mus.musculus.HIPK1..sp.O88904.HIPK1_MOUSE.Homeodom ---KTL--N- H -QF--V---T Site 2076
Aedes.aegypti.CDK8..Cyclin.dependent.kinase.8.OS.A ---QAM--Q- D -PY--F---S Site 2076
Danio.rerio.CDK20.sp.A8WIP6.CDK20_DANRE.Cyclin.dep ---QAL--L- H -PY--F---F Site 2076
Latimeria.chalumnae.CDKL1..tr.H3BGX9.H3BGX9_LATCH. ---QLL--Q- Q -PY--F---D Site 2076
Gallus.gallus.CDK2 ---AAL--S- H -PF--F---R Site 2076
Emericella.nidulans.CDK1 ---QAC--M- H -PY--F---Q Site 2076
Homo.sapiens.MOK..MAPK.MAK.MRK.overlapping.kinase. ---QAL--Q- H -PY--F---Q Site 2076
Homo.sapiens.CDK1 ---MAL--N- H -PY--F---N Site 2076
Candida.albicans.CDK1 ---RAL--I- H -PY--F---N Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Danio.rerio.CK2a1..gi.40538752.ref.NP_571327.1..ca ---EAM--D- H -SY--F---Y Site 2076
Mus.musculus.MAPK7..sp.Q9WVS8.MK07_MOUSE.Mitogen.a ---AAL--R- H -PF--L---A Site 2076
Mus.musculus.ICK..Serine.threonine.protein.kinase. ---QAL--R- Y -PY--F---Q Site 2076
Saccharomyces.castelli.IME2 ---DLC--L- M -EY--F---K Site 2076
Salmo.salar.CLK4..tr.B5X280.B5X280_SALSA.Dual.spec ---QAL--R- H -PF--F---T Site 2076
Mus.musculus.CDK7..sp.Q03147.CDK7_MOUSE.Cyclin.dep ---QAL--K- T -KY--F---S Site 2076
Mus.musculus.CDK14..Cyclin.dependent.kinase.14.OS. ---AAL--S- H -EY--F---S Site 2076
Micromonas.RCC299.GSK3..tr.C1ED07.C1ED07_MICSR.Gly ---EIC--C- H -RY--F---D Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.CDC7..sp.P06243.CDC7_YEAS ---DLL--K- T -PF--F---N Site 2076
Carassius.auratus.CDK7..sp.P51953.CDK7_CARAU.Cycli ---QAL--K- M -RY--F---S Site 2076
Homo.sapiens.CDK9..Cyclin.dependent.kinase.9.OS.Ho ---DAL--N- H -DF--F---W Site 2076
Homo.sapiens.HIPK2..Homeodomain.interacting.protei ---ETL--N- H -PF--V---T Site 2076
Acyrthosiphon.pisum.CDK1 ---KIL--E- M -DY--F---H Site 2076
Candida.tropicalis.CDK1 ---ELA--K- M -PY--F---K Site 2076
Drosophila.melanogaster.CDK8..Cyclin.dependent.kin ---QAM--Q- D -QY--F---Q Site 2076
Suberites.domuncula.GSK3..tr.Q4H118.Q4H118_SUBDO.G ---EAC--A- H -AM--F---N Site 2076
Spodoptera.frugiperda.CSK2a..sp.O76484.CSK2A_SPOFR ---EAM--D- H -PY--F---Y Site 2076
Homo.sapiens.CDK16.sp.Q00536.CDK16_HUMAN.Cyclin.de ---DAM--K- H -PF--F---L Site 2076
Arabidopsis.thaliana.CSK2a1..gi.30698301.ref.NP_20 ---EAM--A- H -AY--F---A Site 2076
Homo.sapiens.CDK17..sp.Q00537.CDK17_HUMAN.Cyclin.d ---EAM--K- H -VY--F---R Site 2076
Meleagris.gallopavo.MAPK13..tr.G1MQ62.G1MQ62_MELGA ---EAL--A- H -PY--F---D Site 2076
Candida.albicans.SSN3..Serine.threonine.protein.ki ---QAL--L- H -PY--F---L Site 2076
Micromonas.sp.RCC299.LF4..long.flagella.protein.LF ---QAL--R- H -PY--F---R Site 2076
Lytechinus.variegatus.GSK3..tr.Q6IUG5.Q6IUG5_LYTVA ---EAC--A- H -QF--F---S Site 2076
Danio.rerio.MAPK13..tr.E7F292.E7F292_DANRE.Unchara ---GAL--A- H -SY--F---D Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Schizosaccharomyces.pombe.CDK9..Probable.cyclin.de ---MAL--E- H -EY--F---T Site 2076
Xenopus.laevis.CSK2a1..sp.P28020.CSK21_XENLA.Casei ---EAM--D- H -PY--F---Y Site 2076
Xenopus.tropicalis.HIPK3..tr.F6SEG6.F6SEG6_XENTR.U ---DTL--S- Q -SF--I---T Site 2076
Mus.musculus.CDK11B.sp.P24788.CD11B_MOUSE.Cyclin.d ---DGL--K- H -EY--F---R Site 2076
Candida.dubliniensis.IME2 ---EIA--K- M -QY--F---K Site 2076
Mus.musculus.MAPK9..sp.Q9WTU6.MK09_MOUSE.Mitogen.a ---EAL--R- H -PY--I---T Site 2076
Aspergillus.niger.IME2 ---QAL--N- H -EY--F---A Site 2076
Xenopus.laevis.MAPK14..sp.P47812.MK14_XENLA.Mitoge ---EAL--A- H -SY--F---A Site 2076
Homo.sapiens.CDKL3..sp.Q8IVW4.CDKL3_HUMAN.Cyclin.d ---DLL--H- H -EY--F---T Site 2076
Homo.sapiens.CDK14..Cyclin.dependent.kinase.14.OS. ---AAL--S- H -EY--F---S Site 2076
Homo.sapiens.CSK2a3...sp.Q8NEV1.CSK23_HUMAN.Casein ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Caenorhabditis.briggsae.DYRK1..Dual.specificity.ty ---TLFPVS- H -TA--Y---N Site 2077
Schizosaccharomyces.japonicus.IME2 ---ECL--A- M -PF--L---Y Site 2076
Caenorhabditis.elegans.MAPK8.sp.Q8WQG9.JNK1_CAEEL. ---DAL--R- H -PY--V---N Site 2076
Gallus.gallus.CDK1 ---MAL--N- H -PY--F---D Site 2076
Homo.sapiens.CDK5..sp.Q00535.CDK5_HUMAN.Cyclin.dep ---EAL--Q- H -PY--F---S Site 2076
Cordyceps.militaris.GSK3..tr.G3JGQ8.G3JGQ8_CORMM.P ---NAM--V- H -PF--F---D Site 2076
Caenorhabditis.briggsae.CDK4..tr.Q8MUK2.Q8MUK2_CAE ---AAL--G- H -EF--L---K Site 2076
Caenorhabditis.elegans.GSK3..sp.Q9U2Q9.GSK3_CAEEL. ---AAC--Q- H -AF--F---D Site 2076
Homo.sapiens.MAPK12..sp.P53778.MK12_HUMAN.Mitogen. ---EAL--A- H -PY--F---E Site 2076
Saccharmomyces.cerevisiase.CK2a2..sp.P19454.CSK22_ ---EAM--D- H -KF--F---K Site 2076
Kluyveromyces.waltii.IME2 ---EIC--A- M -PY--F---A Site 2076
Debaryomyces.hansenii.SKY1 ---GMV--N- H -SW--L---S Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.IME2 ---ELC--E- M -PF--F---E Site 2076
Schizosaccharomyces.japonicus.b.IME2 ---LCI---- L -RY--F---S Site 2074
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Xenopus.tropicalis.CDK6..tr.F6YRJ4.F6YRJ4_XENTR.Un ---SAL--S- H -PY--F---H Site 2076
Gallus.gallus.CSK2a2..sp.P21869.CSK22_CHICK.Casein ---EAM--E- H -PY--F---Y Site 2076
Homo.sapiens.MAPK6..sp.Q16659.MK06_HUMAN.Mitogen.a ---EAL--S- H -PY--M---S Site 2076
Mus.musculus.CDK6..sp.Q64261.CDK6_MOUSE.Cyclin.dep ---GAL--N- H -PY--F---Q Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.MRK1.sp.P50873.MRK1_YEAST ---QCL--L- S -SY--F---D Site 2076
Xenopus.laevis.MAPK12..tr.Q7ZZX6.Q7ZZX6_XENLA.Mapk ---EAL--A- H -AY--F---E Site 2076
Mus.musculus.CDKL3.sp.Q8BLF2.CDKL3_MOUSE.Cyclin.de ---DLL--R- H -DY--F---T Site 2076
Danio.rerio.MAPK8.sp.Q9DGD9.MK08_DANRE.Mitogen.act ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Candida.albicans.IME2 ---EIA--K- M -QY--F---K Site 2076
Xenopus.laevis.CDK4..sp.Q91727.CDK4_XENLA.Cyclin.d ---DAL--L- H -PF--F---A Site 2076
Dictyostelium.discoideum.CDK11..Cyclin.dependent.k ---DAL--K- H -PY--F---F Site 2076
Mus.musculus.MAPK14..sp.P47811.MK14_MOUSE.Mitogen. ---QAL--A- H -AY--F---A Site 2076
Kluyveromyces.lactis.IME2 ---EIC--A- L -PY--F---K Site 2076
Homo.sapiens.MAPK7..Mitogen.activated.protein.kina ---AAL--R- H -PF--L---A Site 2076
Mus.musculus.MAPK10..sp.Q61831.MK10_MOUSE.Mitogen. ---DAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Homo.sapiens.MAPK11..sp.Q15759.MK11_HUMAN.Mitogen. ---EAL--A- H -AY--F---S Site 2076
Drosophila.melanogaster.CK1b...gi.7292799.gb.AAF48 ILFRTL--N- H -QYDYIYDWT Site 2037
Mus.musculus.MAPK11..sp.Q9WUI1.MK11_MOUSE.Mitogen. ---EAL--A- H -AY--F---S Site 2076
Amphimedon.queenslandica.CDK1 ---NGM--R- H -PF--F---S Site 2076
Homo.sapiens.CDKL4..sp.Q5MAI5.CDKL4_HUMAN.Cyclin.d ---QLL--E- S -SY--F---D Site 2076
Taeniopygia.guttata.CDK3..tr.H0ZCU2.H0ZCU2_TAEGU.U ---AAL--N- H -QY--F---L Site 2076
Drosophila.melanogaster.CDK11.sp.Q9VPC0.KP58_DROME ---AAL--K- H -GF--F---K Site 2076
Neurospora.crassa.IME2 ---QAL--A- H -DY--F---T Site 2076
Drosophila.melanogaster.CDK5..sp.P48609.CDK5_DROME ---AAM--Q- H -PY--F---T Site 2076
Dictyostelium.discoideum.DYRK2..Probable.serine.th ---QGL--K- H -DW--I---I Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Mus.musculus.CDK4..sp.P30285.CDK4_MOUSE.Cyclin.dep ---RAL--Q- H -SY--L---H Site 2076
Hydra.magnipapillata.CDK1 ---NAM--N- H -PY--F---D Site 2076
Gallus.gallus.CDK10..tr.F1NCQ0.F1NCQ0_CHICK.Unchar ---DSL--D- S -SY--F---K Site 2076
Ashbya.gossypii.IME2 ---DLS--Q- M -PY--F---A Site 2076
Mus.musculus.TTK..sp.P35761.TTK_MOUSE.Dual.specifi ---ELL--T- H -PY--V---Q Site 2076
Homo.sapiens.DYRK3..Dual.specificity.tyrosine.phos ---QAL--R- H -PW--I---S Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.RIM11..Serine.threonine.p ---QCL--C- S -PY--F---D Site 2076
Danio.rerio.MAPK15..tr.Q0H1F6.Q0H1F6_DANRE.Extrace ---EAL--R- H -PY--V---S Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.b.IME2 ---YCK---- E -VF--F---P Site 2074
Mus.musculus.MAPK1..sp.P63085.MK01_MOUSE.Mitogen.a ---QAL--A- H -PY--L---E Site 2076
Mus.musculus.HIPK3..sp.Q9ERH7.HIPK3_MOUSE.Homeodom ---ETL--N- H -PF--V---N Site 2076
Schizosaccharomyces.pombe.CDK1 ---RAL--Q- Q -NY--L---R Site 2076
Oryzias.latipes.CLK2a..tr.H2LBC0.H2LBC0_ORYLA.Unch ---DSL--K- H -PF--F---E Site 2076
Saccoglossus.kowalevskii.CDK1 ---TAL--S- H -RY--F---R Site 2076
Mus.musculus.CK1..gi.20544149.ref.NP_620690.1..cas ERERKV--S- M -RLHRGAPVN Site 2485
Mus.musculus.MAPK8.sp.Q91Y86.MK08_MOUSE.Mitogen.ac ---EAL--Q- H -PY--I---N Site 2076
Mus.musculus.CDK3..sp.Q80YP0.CDK3_MOUSE.Cyclin.dep ---TAL--A- H -PY--F---S Site 2076
Mus.musculus.SGK71..sp.Q80YS9.SGK71_MOUSE.Probable ---DVM--Q- V -TF--M---S Site 1916
Homo.sapiens.CDK3..sp.Q00526.CDK3_HUMAN.Cyclin.dep ---TAL--A- H -PY--F---S Site 2076
Yarrowia.lipolytica.IME2 ---DIM--Y- H -RY--F---A Site 2076
Saccharomyces.cerevisiae.SSN3..Meiotic.mRNA.stabil ---NAL--E- H -KY--F---T Site 2076
Carassius.auratus.CDK2..sp.P43450.CDK2_CARAU.Cycli ---NAL--V- H -RF--F---R Site 2076
Kluyveromyces.lactis.CDC7.tr.Q6CUJ8.Q6CUJ8_KLULA.K ---DLL--E- H -LW--F---K Site 2076
Neurospora.crassa.GSK3..tr.Q9HE92.Q9HE92_NEUCS.Gly ---DAM--V- H -PF--F---D Site 2076
Schizosaccharomyces.pombo.GSK3..Protein.kinase.gsk ---EAM--C- H -PF--F---D Site 2076
Species Residue at Site 3310
in 'msaprobs'
muscle

The residue for every species at site 3310 of the msaprobs alignment can be found in the muscle alignment, but with a possibly different site number.

Caenorhabditis.elegans.MBK1..Dual.specificity.tyro ---YVV--R- H -PF--L---K Site 2076
Mus.musculus.NLK..sp.O54949.NLK_MOUSE.Serine.threo ---DAL--A- H -PY--L---D Site 2076
Scheffersomyces.stipitis.SKY1 ---GMV--N- H -PW--L---S Site 2076
Mus.musculus.CDK5..sp.P49615.CDK5_MOUSE.Cyclin.dep ---EAL--Q- H -PY--F---S Site 2076

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