Rubisco and Rubisco-like (v4) Ancestral Library

If you use these results in your work, please cite: Hanson-Smith and Johnson, PLoS Comp. Bio., 2016


Overview | Alignments | Sites | Trees | Ancestors | Mutations


Select a Tree:

Select a tree and branch by choosing a combination of one alignment method, one phylogenetic model, and two ancestral nodes on the maximum likelihood tree from that method-model combo.

Alignment Method:

Markov Model:

 

Select a Branch:

From Ancestor:

To Ancestor:


(Optional) Map Mutations to Sequence:

Select a Sequence Name:

Summary

There are 23 substitutions with strong support on the branch(es) connecting Node100 to Node101. These substitutions are listed below:

Site in msaprobs

Site in msaprobs

The index of the substitution sequence site in the alignment generated by msaprobs.

Site in A.Acidithiobacillus.GammaP

Site in A.Acidithiobacillus.GammaP

The index of the substitution sequence site in the present-day sequence named A.Acidithiobacillus.GammaP. Due to the placement of insertion/deletion characters within the sequence alignment, the sequence index for A.Acidithiobacillus.GammaP if likely to be different from the overall sequence index for the alignment msaprobs.

Substitution

Substitution

The amino acid substitution is represented as X→Y, where X is the ancestral state and Y is the descendant state. In some cases, the mutation reported here may be from the same state (i.e., X→X). In this case, scroll down to the 'Detail' table, and you'll see that other alignments and models support a substitution at this site (i.e. X→Y), but the method and model you've currently selected is an outlier and does not support the substition.

Weight

Weight

This is a count of the number of pairs of alignment method and phylogenetic model that strongly support a substitution at this sequence site.

106 41 YH 5
135 68 DE 6
201 none FM 6
238 140 ML 6
243 145 AS 6
306 205 CA 4
312 211 LI 6
323 222 QM 6
328 227 QE 6
379 270 VI 6
416 305 FY 6
443 331 ED 4
448 336 VA 6
453 341 MI 6
463 351 ES 6
464 352 CY 6
465 353 QT 6
470 358 FH 6
472 360 KE 6
517 399 SA 6
529 411 VT 4
594 none KQ 4
695 473 KA 3

Detail

The following table shows the substitution profile at every site on the branch(es) connecting Node100 to Node101:

Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 1 1: M M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 2 2: A D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.998)
D (0.999)→
D (0.998)
Site 3 3: V Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 12 4: K S (1.0)→
S (0.999)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (0.999)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (0.999)
S (1.0)→
S (0.999)
Site 61 7: E N (0.961)→
N (0.998)
N (0.962)→
N (0.998)
N (0.961)→
N (0.998)
N (0.961)→
N (0.998)
N (0.977)→
N (0.999)
N (0.977)→
N (0.999)
Site 66 12: E R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (0.999)
Site 70 13: Y Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 71 14: R A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 72 none D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 73 15: Q L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 74 16: T S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 75 17: Y L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 82 18: W K (0.992)→
K (0.989)
K (0.992)→
K (0.989)
K (0.992)→
K (0.989)
K (0.992)→
K (0.989)
K (0.994)→
K (0.992)
K (0.994)→
K (0.992)
Site 83 19: A E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 84 20: P E (0.846)→
E (0.833)
E (0.816)→
E (0.803)
E (0.846)→
E (0.833)
E (0.812)→
E (0.799)
E (0.817)→
E (0.809)
E (0.812)→
E (0.804)
Site 85 21: E D (0.93)→
D (0.873)
D (0.934)→
D (0.878)
D (0.93)→
D (0.874)
D (0.932)→
D (0.875)
D (0.943)→
D (0.879)
D (0.939)→
D (0.872)
Site 86 22: Y L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 87 23: V I (0.998)→
I (0.996)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.998)→
I (0.996)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.997)
I (0.999)→
I (0.998)
Site 88 24: P A (0.999)→
A (0.999)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (0.999)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 89 25: L G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 92 27: S Q (0.537)→
Q (0.543)
Q (0.529)→
Q (0.534)
Q (0.537)→
Q (0.543)
Q (0.535)→
Q (0.541)
Q (0.561)→
Q (0.567)
Q (0.605)→
Q (0.61)
Site 93 28: D H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 94 29: I I (1.0)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (1.0)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
Site 95 30: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 96 31: A C (0.686)→
C (0.689)
C (0.697)→
C (0.699)
C (0.686)→
C (0.688)
C (0.702)→
C (0.704)
C (0.706)→
C (0.707)
C (0.703)→
C (0.704)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 97 32: C A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 98 33: F Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 99 34: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 100 35: I M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 101 36: T K (0.999)→
K (1.0)
K (0.999)→
K (1.0)
K (0.999)→
K (1.0)
K (0.999)→
K (1.0)
K (0.999)→
K (1.0)
K (0.999)→
K (1.0)
Site 102 37: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 103 38: Q K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 104 39: P A (0.634)→
A (0.941)
A (0.844)→
A (0.982)
A (0.634)→
A (0.941)
A (0.842)→
A (0.982)
A (0.853)→
A (0.978)
A (0.851)→
A (0.978)
Site 105 40: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 106 41: V Y (0.683)→
H (0.988)
Y (0.651)→
H (0.991)
Y (0.683)→
H (0.988)
Y (0.643)→
H (0.991)
Y (0.497)→
H (0.991)
H (0.496)→
H (0.991)
Site 107 42: D G (0.986)→
G (0.984)
G (0.991)→
G (0.987)
G (0.986)→
G (0.984)
G (0.991)→
G (0.987)
G (0.991)→
G (0.98)
G (0.991)→
G (0.98)
Site 109 43: R Y (1.0)→
Y (0.999)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (0.999)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 110 44: E L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 111 45: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 112 46: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 113 47: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 114 48: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 115 49: A H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 116 50: V F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 117 51: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 118 52: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 119 53: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 120 54: S S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 121 55: S S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 122 56: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 123 57: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 124 58: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 125 59: W N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 126 60: T V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 127 61: T E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 128 62: V V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 129 63: W C (0.852)→
C (0.852)
C (0.846)→
C (0.846)
C (0.851)→
C (0.851)
C (0.851)→
C (0.851)
C (0.872)→
C (0.872)
C (0.853)→
C (0.853)
Site 130 64: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 133 66: L T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 134 67: L D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 135 68: T D (0.991)→
E (0.97)
D (0.989)→
E (0.965)
D (0.991)→
E (0.97)
D (0.989)→
E (0.964)
D (0.986)→
E (0.961)
D (0.985)→
E (0.96)
Site 136 69: D F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 137 70: M T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 138 71: D K (0.954)→
K (0.993)
K (0.967)→
K (0.997)
K (0.954)→
K (0.993)
K (0.968)→
K (0.997)
K (0.971)→
K (0.997)
K (0.972)→
K (0.997)
Site 139 72: Y G (0.995)→
G (1.0)
G (0.996)→
G (1.0)
G (0.995)→
G (1.0)
G (0.996)→
G (1.0)
G (0.993)→
G (0.999)
G (0.993)→
G (0.999)
Site 140 73: Y V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 141 74: K D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 142 75: G A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 143 76: R L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 144 77: A V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 145 78: Y Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 146 79: R Y (0.919)→
Y (0.535)
Y (0.955)→
Y (0.513)
Y (0.919)→
Y (0.535)
Y (0.956)→
Y (0.514)
Y (0.931)→
H (0.54)
Y (0.932)→
H (0.541)
Site 147 80: I I (0.99)→
I (0.999)
I (0.992)→
I (0.999)
I (0.99)→
I (0.999)
I (0.992)→
I (0.999)
I (0.99)→
I (0.999)
I (0.991)→
I (0.999)
Site 148 81: E D (0.994)→
D (1.0)
D (0.994)→
D (1.0)
D (0.994)→
D (1.0)
D (0.993)→
D (1.0)
D (0.993)→
D (0.999)
D (0.993)→
D (0.999)
Site 149 82: D E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 150 83: V A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 180 89: S S (0.774)→
S (0.77)
S (0.761)→
S (0.76)
S (0.773)→
S (0.77)
S (0.76)→
S (0.759)
S (0.774)→
S (0.774)
S (0.777)→
S (0.777)
Site 181 90: F E (0.999)→
E (0.999)
E (0.999)→
E (0.999)
E (0.999)→
E (0.999)
E (0.999)→
E (0.999)
E (0.998)→
E (0.998)
E (0.998)→
E (0.998)
Site 182 91: Y D (0.996)→
D (0.975)
D (0.995)→
D (0.97)
D (0.996)→
D (0.975)
D (0.995)→
D (0.97)
D (0.994)→
D (0.958)
D (0.994)→
D (0.957)
Site 183 92: A M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 184 93: F R (0.999)→
R (1.0)
R (0.999)→
R (1.0)
R (0.999)→
R (1.0)
R (0.999)→
R (1.0)
R (0.999)→
R (1.0)
R (0.999)→
R (1.0)
Site 185 94: I I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 186 95: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 187 96: Y Y (1.0)→
Y (0.996)
Y (1.0)→
Y (0.996)
Y (1.0)→
Y (0.996)
Y (1.0)→
Y (0.996)
Y (1.0)→
Y (0.996)
Y (1.0)→
Y (0.996)
Site 188 97: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 189 98: I L (0.997)→
L (0.968)
L (0.997)→
L (0.967)
L (0.997)→
L (0.968)
L (0.997)→
L (0.967)
L (0.999)→
L (0.979)
L (0.999)→
L (0.98)
Site 190 99: D D (0.561)→
D (0.951)
D (0.636)→
D (0.963)
D (0.557)→
D (0.95)
D (0.631)→
D (0.962)
D (0.718)→
D (0.974)
D (0.716)→
D (0.973)
Site 191 100: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 192 101: F F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 193 102: E D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 194 103: E R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 195 104: G N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 196 none I (0.713)→
I (0.785)
I (0.795)→
I (0.835)
I (0.713)→
I (0.785)
I (0.796)→
I (0.836)
I (0.709)→
I (0.757)
I (0.711)→
I (0.758)
Site 197 none T (0.995)→
T (0.981)
T (0.997)→
T (0.988)
T (0.995)→
T (0.981)
T (0.997)→
T (0.989)
T (0.994)→
T (0.978)
T (0.994)→
T (0.979)
Site 198 none D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 199 none G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 200 none R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 201 none F (0.945)→
M (0.956)
F (0.963)→
M (0.973)
F (0.945)→
M (0.956)
F (0.963)→
M (0.973)
F (0.959)→
M (0.97)
F (0.959)→
M (0.97)
Site 202 105: S M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 203 106: V L (0.785)→
L (0.377)
L (0.744)→
I (0.37)
L (0.785)→
L (0.377)
L (0.751)→
I (0.363)
L (0.741)→
M (0.385)
L (0.749)→
M (0.39)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 204 107: V V (0.999)→
V (0.983)
V (1.0)→
V (0.988)
V (0.999)→
V (0.983)
V (1.0)→
V (0.988)
V (1.0)→
V (0.987)
V (1.0)→
V (0.987)
Site 205 108: N S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 206 109: V F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 207 110: F L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 208 111: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 209 112: S L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 210 113: L A (0.984)→
A (0.445)
A (0.982)→
A (0.516)
A (0.984)→
A (0.445)
A (0.982)→
A (0.517)
A (0.979)→
A (0.671)
A (0.981)→
A (0.675)
Site 211 114: V I (0.995)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.994)→
I (1.0)
Site 212 115: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 213 116: N N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 214 117: V N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 216 118: F Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 217 119: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 218 120: F M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 219 121: K G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 220 122: A D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 221 123: V I (0.998)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.998)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
Site 222 124: R E (0.977)→
E (0.967)
E (0.972)→
E (0.961)
E (0.977)→
E (0.967)
E (0.971)→
E (0.96)
E (0.976)→
E (0.969)
E (0.974)→
E (0.969)
Site 223 125: A H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 224 126: L A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 225 127: R K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 226 128: L M (1.0)→
M (0.998)
M (1.0)→
M (0.998)
M (1.0)→
M (0.998)
M (1.0)→
M (0.998)
M (1.0)→
M (0.997)
M (1.0)→
M (0.997)
Site 227 129: E I (0.971)→
I (0.537)
I (0.982)→
I (0.614)
I (0.971)→
I (0.537)
I (0.982)→
I (0.614)
I (0.98)→
I (0.683)
I (0.98)→
I (0.684)
Site 228 130: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 229 131: V F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 230 132: R Y (1.0)→
Y (0.982)
Y (1.0)→
Y (0.985)
Y (1.0)→
Y (0.982)
Y (1.0)→
Y (0.986)
Y (1.0)→
Y (0.989)
Y (1.0)→
Y (0.989)
Site 231 133: F V (0.999)→
V (0.984)
V (0.999)→
V (0.982)
V (0.999)→
V (0.984)
V (0.999)→
V (0.982)
V (0.999)→
V (0.981)
V (0.999)→
V (0.98)
Site 232 134: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 233 135: L E (0.989)→
E (0.389)
E (0.985)→
E (0.332)
E (0.989)→
E (0.389)
E (0.985)→
E (0.333)
E (0.98)→
R (0.377)
E (0.98)→
R (0.379)
Site 234 136: A R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 235 137: Y C (0.403)→
A (0.753)
A (0.43)→
A (0.754)
C (0.403)→
A (0.753)
A (0.432)→
A (0.753)
V (0.31)→
A (0.527)
C (0.3)→
A (0.51)
Site 236 138: V I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.999)
Site 237 139: K Q (1.0)→
Q (0.987)
Q (1.0)→
Q (0.985)
Q (1.0)→
Q (0.987)
Q (1.0)→
Q (0.985)
Q (1.0)→
Q (0.991)
Q (1.0)→
Q (0.991)
Site 238 140: T M (0.764)→
L (0.936)
M (0.739)→
L (0.95)
M (0.764)→
L (0.936)
M (0.743)→
L (0.95)
M (0.732)→
L (0.962)
M (0.742)→
L (0.962)
Site 239 141: C F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 240 142: N D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.998)
D (0.999)→
D (0.998)
Site 241 143: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 242 144: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 243 145: P A (0.959)→
S (0.962)
A (0.973)→
S (0.974)
A (0.959)→
S (0.962)
A (0.972)→
S (0.974)
A (0.965)→
S (0.971)
A (0.963)→
S (0.97)
Site 244 146: H K (0.978)→
K (1.0)
K (0.975)→
K (1.0)
K (0.978)→
K (1.0)
K (0.976)→
K (1.0)
K (0.984)→
K (1.0)
K (0.984)→
K (1.0)
Site 245 147: G D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 246 148: I I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 247 149: Q S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 248 150: V D (0.98)→
D (0.999)
D (0.976)→
D (0.999)
D (0.98)→
D (0.999)
D (0.975)→
D (0.999)
D (0.982)→
D (0.999)
D (0.981)→
D (0.999)
Site 249 151: E L (0.994)→
L (0.979)
L (0.996)→
L (0.984)
L (0.994)→
L (0.979)
L (0.996)→
L (0.984)
L (0.997)→
L (0.989)
L (0.997)→
L (0.988)
Site 250 152: R W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
Site 251 153: D R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 252 154: K I (0.995)→
I (0.961)
I (0.994)→
I (0.962)
I (0.994)→
I (0.96)
I (0.993)→
I (0.96)
I (0.991)→
I (0.957)
I (0.992)→
I (0.961)
Site 253 155: M L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 254 156: N G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 255 157: K R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 256 none P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 257 none V (0.998)→
V (0.997)
V (1.0)→
V (0.999)
V (0.998)→
V (0.997)
V (1.0)→
V (0.999)
V (0.999)→
V (0.998)
V (0.999)→
V (0.998)
Site 258 none K (0.986)→
K (0.999)
K (0.984)→
K (0.999)
K (0.986)→
K (0.999)
K (0.984)→
K (0.999)
K (0.99)→
K (0.999)
K (0.99)→
K (0.999)
Site 259 158: Y D (0.959)→
D (0.997)
D (0.957)→
D (0.997)
D (0.959)→
D (0.997)
D (0.956)→
D (0.997)
D (0.95)→
D (0.996)
D (0.945)→
D (0.995)
Site 260 159: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 261 160: R G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 262 161: P Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.997)→
Y (1.0)
Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.997)→
Y (1.0)
Y (0.998)→
Y (1.0)
Y (0.997)→
Y (1.0)
Site 263 162: M I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 264 163: L A (0.996)→
A (1.0)
A (0.997)→
A (1.0)
A (0.996)→
A (1.0)
A (0.996)→
A (1.0)
A (0.994)→
A (1.0)
A (0.993)→
A (1.0)
Site 265 164: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 266 165: C T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 267 166: T I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 268 167: I I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 269 168: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 270 169: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 271 170: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 272 171: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 273 172: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 274 173: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 275 174: S R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 276 175: A P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 277 176: K E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 278 177: N P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 279 178: Y F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 280 179: G A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 281 180: R Q (0.911)→
Q (0.913)
Q (0.917)→
Q (0.923)
Q (0.911)→
Q (0.913)
Q (0.918)→
Q (0.924)
Q (0.923)→
Q (0.924)
Q (0.916)→
Q (0.917)
Site 282 181: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 283 182: V A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 284 183: Y Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 285 184: E Q (1.0)→
Q (0.99)
Q (1.0)→
Q (0.991)
Q (1.0)→
Q (0.99)
Q (1.0)→
Q (0.991)
Q (1.0)→
Q (0.993)
Q (1.0)→
Q (0.993)
Site 286 185: C F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 287 186: L W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
Site 288 187: R L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 289 188: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 290 189: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 292 191: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 293 192: F F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 294 193: T I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 295 194: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 296 195: D N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 297 196: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 298 197: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 299 198: N P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 300 199: V Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 301 200: N G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 302 201: S N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 303 202: Q Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 304 203: P V (0.981)→
V (0.955)
V (0.991)→
V (0.974)
V (0.981)→
V (0.955)
V (0.991)→
V (0.974)
V (0.994)→
V (0.98)
V (0.994)→
V (0.98)
Site 305 204: F F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 306 205: M C (0.482)→
A (0.977)
C (0.376)→
A (0.977)
C (0.482)→
A (0.977)
C (0.368)→
A (0.977)
S (0.481)→
A (0.964)
S (0.486)→
A (0.967)
Site 307 206: R P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 308 207: W L (0.691)→
L (0.685)
L (0.612)→
L (0.61)
L (0.691)→
L (0.685)
L (0.617)→
L (0.616)
L (0.561)→
L (0.562)
L (0.647)→
L (0.645)
Site 309 208: R K (1.0)→
K (0.993)
K (1.0)→
K (0.991)
K (1.0)→
K (0.993)
K (1.0)→
K (0.991)
K (1.0)→
K (0.993)
K (1.0)→
K (0.993)
Site 310 209: D K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 311 210: R V (0.999)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (0.999)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 312 211: F L (0.716)→
I (0.445)
L (0.678)→
I (0.486)
L (0.716)→
I (0.445)
L (0.685)→
I (0.482)
L (0.662)→
I (0.517)
L (0.67)→
I (0.512)
Site 313 212: L P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 314 213: F L (0.999)→
L (0.999)
L (1.0)→
L (1.0)
L (0.999)→
L (0.999)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 315 214: V V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 316 215: A Y (0.999)→
Y (0.989)
Y (1.0)→
Y (0.992)
Y (0.999)→
Y (0.988)
Y (1.0)→
Y (0.992)
Y (0.999)→
Y (0.988)
Y (0.999)→
Y (0.988)
Site 317 216: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 318 217: A A (1.0)→
A (0.975)
A (1.0)→
A (0.981)
A (1.0)→
A (0.975)
A (1.0)→
A (0.982)
A (1.0)→
A (0.98)
A (1.0)→
A (0.98)
Site 319 218: I M (0.996)→
M (1.0)
M (0.997)→
M (1.0)
M (0.996)→
M (1.0)
M (0.997)→
M (1.0)
M (0.997)→
M (1.0)
M (0.997)→
M (1.0)
Site 320 219: H K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (0.999)
Site 321 220: T R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 322 221: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 323 222: E Q (0.997)→
M (0.99)
Q (0.998)→
M (0.992)
Q (0.997)→
M (0.99)
Q (0.998)→
M (0.992)
Q (0.999)→
M (0.996)
Q (0.999)→
M (0.996)
Site 324 223: A D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 325 224: E E (0.998)→
E (1.0)
E (0.999)→
E (1.0)
E (0.998)→
E (1.0)
E (0.999)→
E (1.0)
E (0.998)→
E (1.0)
E (0.998)→
E (1.0)
Site 326 225: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 327 226: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 328 227: E Q (0.871)→
E (0.979)
Q (0.872)→
E (0.974)
Q (0.871)→
E (0.979)
Q (0.872)→
E (0.974)
Q (0.874)→
E (0.984)
Q (0.787)→
E (0.986)
Site 329 228: R A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 330 229: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 331 230: G L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 332 231: H F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 334 232: Y S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 335 233: L M (0.999)→
M (0.997)
M (0.999)→
M (0.998)
M (0.999)→
M (0.997)
M (0.999)→
M (0.998)
M (1.0)→
M (0.997)
M (1.0)→
M (0.997)
Site 336 234: N N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 337 235: V I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 338 236: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 339 237: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 340 238: P D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
Site 341 239: S D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 342 240: P H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 343 241: E Y (0.783)→
Y (0.764)
Y (0.78)→
Y (0.767)
Y (0.783)→
Y (0.764)
Y (0.774)→
Y (0.761)
Y (0.758)→
Y (0.746)
Y (0.751)→
Y (0.74)
Site 344 242: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 345 243: M M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 346 244: Y C (1.0)→
C (0.997)
C (1.0)→
C (0.999)
C (1.0)→
C (0.997)
C (1.0)→
C (0.999)
C (1.0)→
C (0.999)
C (1.0)→
C (0.999)
Site 347 245: E A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 348 246: R R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 349 247: A A (1.0)→
A (0.993)
A (1.0)→
A (0.995)
A (1.0)→
A (0.992)
A (1.0)→
A (0.995)
A (1.0)→
A (0.994)
A (1.0)→
A (0.994)
Site 350 248: E D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 351 249: F Y (0.785)→
Y (0.757)
Y (0.776)→
Y (0.746)
Y (0.785)→
Y (0.757)
Y (0.77)→
Y (0.741)
Y (0.754)→
Y (0.728)
Y (0.748)→
Y (0.721)
Site 352 250: A A (0.994)→
A (0.988)
A (0.996)→
A (0.991)
A (0.994)→
A (0.987)
A (0.996)→
A (0.991)
A (0.996)→
A (0.991)
A (0.996)→
A (0.991)
Site 353 251: K L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 354 252: E E (1.0)→
E (0.991)
E (1.0)→
E (0.992)
E (1.0)→
E (0.992)
E (1.0)→
E (0.993)
E (1.0)→
E (0.994)
E (1.0)→
E (0.994)
Site 355 none T (0.992)→
T (0.966)
T (0.996)→
T (0.974)
T (0.992)→
T (0.966)
T (0.996)→
T (0.973)
T (0.978)→
T (0.934)
T (0.977)→
T (0.934)
Site 356 253: L F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (0.999)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 357 254: N G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 358 255: M P (0.951)→
P (0.999)
P (0.947)→
P (0.999)
P (0.951)→
P (0.999)
P (0.949)→
P (0.999)
P (0.925)→
P (0.999)
P (0.925)→
P (0.998)
Site 361 256: P D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 362 none A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 363 none D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (1.0)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.999)
Site 364 none K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 365 none L (0.988)→
L (0.975)
L (0.987)→
L (0.974)
L (0.988)→
L (0.975)
L (0.987)→
L (0.975)
L (0.99)→
L (0.98)
L (0.991)→
L (0.98)
Site 366 257: I A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 367 258: I F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 368 259: M L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 369 260: H V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 370 261: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 371 262: F G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 372 263: L Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.995)→
Y (1.0)
Y (0.996)→
Y (1.0)
Y (0.996)→
Y (1.0)
Site 373 264: T V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 374 265: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 375 266: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 376 267: F P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 377 268: C G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 378 269: A M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 379 270: N V (0.843)→
I (0.942)
V (0.862)→
I (0.953)
V (0.843)→
I (0.942)
V (0.86)→
I (0.952)
V (0.834)→
I (0.948)
V (0.829)→
I (0.948)
Site 380 271: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 381 272: G T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 382 273: L A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 383 274: A R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 384 275: R R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (0.999)
Site 385 276: W Q (1.0)→
Q (0.996)
Q (1.0)→
Q (0.992)
Q (1.0)→
Q (0.996)
Q (1.0)→
Q (0.992)
Q (1.0)→
Q (0.994)
Q (1.0)→
Q (0.994)
Site 388 279: K Y (0.996)→
Y (0.958)
Y (0.997)→
Y (0.967)
Y (0.996)→
Y (0.958)
Y (0.997)→
Y (0.968)
Y (0.998)→
Y (0.973)
Y (0.998)→
Y (0.973)
Site 389 280: T P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 390 281: G N (0.997)→
N (1.0)
N (0.997)→
N (1.0)
N (0.997)→
N (1.0)
N (0.998)→
N (1.0)
N (0.997)→
N (1.0)
N (0.997)→
N (1.0)
Site 391 282: T Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 392 283: L Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 393 284: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 394 285: H H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 395 286: I Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 396 287: H H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 397 288: R R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 398 289: A A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
Site 399 290: M G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 400 291: H H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 401 292: A G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 402 293: V A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
A (0.999)→
A (1.0)
Site 403 294: V V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 404 295: D T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 405 296: R S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 406 none P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 407 297: N S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 408 298: P S (0.829)→
S (0.826)
S (0.849)→
S (0.846)
S (0.829)→
S (0.826)
S (0.842)→
S (0.839)
S (0.847)→
S (0.845)
S (0.842)→
S (0.84)
Site 409 299: H K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (0.999)
Site 410 300: H R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 411 301: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 412 302: I Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 413 303: H T (1.0)→
T (0.998)
T (1.0)→
T (0.998)
T (1.0)→
T (0.998)
T (1.0)→
T (0.998)
T (1.0)→
T (0.998)
T (1.0)→
T (0.998)
Site 415 304: F A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 416 305: R F (0.936)→
Y (0.956)
F (0.904)→
Y (0.966)
F (0.936)→
Y (0.956)
F (0.901)→
Y (0.966)
F (0.936)→
Y (0.971)
F (0.934)→
Y (0.971)
Site 417 306: V V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 418 307: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 419 308: V A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 420 309: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 421 310: A M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 422 311: L S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 423 312: R R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 424 313: L L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 425 314: S Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 426 315: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 427 316: G A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 428 317: D S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 429 318: H G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 430 319: L I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 431 320: H H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 432 321: T V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
V (1.0)→
V (1.0)
Site 433 322: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 434 323: T T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 435 324: V M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 436 none G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 437 325: V Y (0.998)→
Y (1.0)
Y (0.999)→
Y (1.0)
Y (0.998)→
Y (1.0)
Y (0.998)→
Y (1.0)
Y (0.998)→
Y (1.0)
Y (0.998)→
Y (1.0)
Site 438 326: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 439 327: K K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 440 328: L M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 441 329: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 442 330: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 443 331: D E (0.569)→
D (0.562)
E (0.564)→
D (0.524)
E (0.569)→
D (0.562)
E (0.563)→
D (0.523)
D (0.604)→
D (0.741)
D (0.608)→
D (0.742)
Site 444 332: R G (0.958)→
K (0.309)
G (0.955)→
K (0.382)
G (0.958)→
K (0.309)
G (0.956)→
K (0.383)
G (0.956)→
R (0.342)
G (0.958)→
R (0.339)
Site 445 333: A D (0.999)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.999)
D (0.999)→
D (0.999)
D (0.998)→
D (0.998)
D (0.998)→
D (0.998)
Site 446 334: S D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 447 335: T R (0.948)→
R (0.998)
R (0.952)→
R (0.998)
R (0.948)→
R (0.998)
R (0.953)→
R (0.998)
R (0.953)→
R (0.998)
R (0.954)→
R (0.998)
Site 448 336: Q V (0.819)→
A (0.895)
V (0.813)→
A (0.923)
V (0.819)→
A (0.895)
V (0.811)→
A (0.923)
V (0.713)→
A (0.883)
V (0.713)→
A (0.884)
Site 449 337: G I (0.909)→
I (0.874)
I (0.914)→
I (0.895)
I (0.909)→
I (0.874)
I (0.914)→
I (0.895)
I (0.916)→
I (0.911)
I (0.914)→
I (0.907)
Site 450 338: W A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 451 339: V Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 453 341: L M (0.992)→
I (0.953)
M (0.991)→
I (0.952)
M (0.992)→
I (0.953)
M (0.99)→
I (0.952)
M (0.989)→
I (0.945)
M (0.99)→
I (0.95)
Site 454 342: L I (1.0)→
I (0.999)
I (1.0)→
I (0.999)
I (1.0)→
I (0.999)
I (1.0)→
I (0.999)
I (0.999)→
I (0.998)
I (0.999)→
I (0.998)
Site 455 343: R E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 456 344: E R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (0.999)
Site 462 350: D D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 463 351: R E (0.994)→
S (0.98)
E (0.993)→
S (0.987)
E (0.994)→
S (0.98)
E (0.993)→
S (0.987)
E (0.993)→
S (0.987)
E (0.994)→
S (0.989)
Site 464 352: S C (0.999)→
Y (0.99)
C (0.999)→
Y (0.993)
C (0.999)→
Y (0.99)
C (0.999)→
Y (0.993)
C (0.998)→
Y (0.985)
C (0.998)→
Y (0.985)
Site 465 353: R Q (0.998)→
T (0.985)
Q (0.998)→
T (0.989)
Q (0.998)→
T (0.985)
Q (0.998)→
T (0.989)
Q (0.999)→
T (0.991)
Q (0.999)→
T (0.99)
Site 466 354: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 467 355: I P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 468 356: F V (0.998)→
V (0.986)
V (0.998)→
V (0.986)
V (0.998)→
V (0.986)
V (0.998)→
V (0.986)
V (0.996)→
V (0.975)
V (0.996)→
V (0.975)
Site 469 357: F Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 470 358: D F (0.704)→
H (0.953)
F (0.791)→
H (0.975)
F (0.704)→
H (0.953)
F (0.797)→
H (0.975)
F (0.665)→
H (0.95)
F (0.673)→
H (0.951)
Site 471 359: Q Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 472 360: D K (0.994)→
E (0.976)
K (0.992)→
E (0.968)
K (0.994)→
E (0.976)
K (0.991)→
E (0.968)
K (0.994)→
E (0.978)
K (0.993)→
E (0.978)
Site 473 361: W W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
Site 474 362: G Y (1.0)→
Y (0.999)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (0.999)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 475 363: S G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 481 364: M M (0.998)→
M (1.0)
M (0.998)→
M (1.0)
M (0.998)→
M (1.0)
M (0.998)→
M (1.0)
M (0.998)→
M (1.0)
M (0.997)→
M (1.0)
Site 482 365: P K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 483 366: G P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 484 367: V T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 485 368: F T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 486 369: A P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 487 370: V I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 488 371: A I (0.995)→
I (1.0)
I (0.996)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.996)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
I (0.995)→
I (1.0)
Site 489 372: S S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 490 373: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 491 374: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 492 375: I M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
M (1.0)→
M (1.0)
Site 493 376: H N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 494 377: V A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 495 378: W L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 496 379: H R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 497 380: M L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 498 381: P P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 499 382: S G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 500 383: L F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 501 384: L F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 502 385: A E (0.972)→
E (0.995)
E (0.966)→
E (0.994)
E (0.972)→
E (0.995)
E (0.966)→
E (0.994)
E (0.956)→
E (0.991)
E (0.956)→
E (0.991)
Site 503 386: I N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 504 387: F L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 505 388: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 506 389: D H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 507 none G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 508 390: D N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 509 391: A V (0.983)→
V (0.998)
V (0.988)→
V (0.999)
V (0.983)→
V (0.998)
V (0.988)→
V (0.999)
V (0.984)→
V (0.998)
V (0.984)→
V (0.998)
Site 510 392: V I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
I (1.0)→
I (1.0)
Site 511 393: F N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
N (1.0)→
N (1.0)
Site 512 394: Q T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
T (1.0)→
T (1.0)
Site 513 395: F A (0.986)→
A (0.969)
A (0.987)→
A (0.972)
A (0.986)→
A (0.969)
A (0.987)→
A (0.972)
A (0.975)→
A (0.959)
A (0.978)→
A (0.962)
Site 514 396: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 515 397: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 516 398: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 517 399: T S (0.995)→
A (0.963)
S (0.996)→
A (0.97)
S (0.995)→
A (0.963)
S (0.996)→
A (0.97)
S (0.995)→
A (0.97)
S (0.995)→
A (0.97)
Site 518 400: L Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 519 401: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 520 402: H H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 521 403: P I (0.998)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.998)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
I (0.999)→
I (1.0)
Site 522 404: W D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 523 405: G S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 524 406: N P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 525 407: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 526 408: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 527 409: G G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 528 410: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 529 411: A V (0.394)→
T (0.644)
I (0.457)→
T (0.597)
V (0.394)→
T (0.644)
I (0.455)→
T (0.595)
I (0.566)→
T (0.587)
I (0.546)→
T (0.596)
Site 530 412: A S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 531 413: N L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 532 414: R R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (1.0)
Site 533 415: V Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Q (1.0)→
Q (1.0)
Site 534 416: A A (0.99)→
A (1.0)
A (0.992)→
A (1.0)
A (0.99)→
A (1.0)
A (0.991)→
A (1.0)
A (0.993)→
A (1.0)
A (0.992)→
A (1.0)
Site 535 417: L Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Y (1.0)→
Y (1.0)
Site 536 418: E E (1.0)→
E (0.98)
E (1.0)→
E (0.979)
E (1.0)→
E (0.98)
E (1.0)→
E (0.979)
E (1.0)→
E (0.975)
E (1.0)→
E (0.974)
Site 537 419: A C (1.0)→
C (1.0)
C (1.0)→
C (1.0)
C (1.0)→
C (1.0)
C (1.0)→
C (1.0)
C (1.0)→
C (1.0)
C (1.0)→
C (1.0)
Site 538 420: C W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
Site 539 421: V K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (1.0)
Site 543 422: E A (0.971)→
A (0.995)
A (0.987)→
A (0.998)
A (0.971)→
A (0.995)
A (0.987)→
A (0.998)
A (0.979)→
A (0.996)
A (0.979)→
A (0.995)
Site 544 423: A G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (0.999)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (0.999)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 553 424: R A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 554 425: N D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 569 438: L P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 570 439: T I (0.985)→
I (0.873)
I (0.994)→
I (0.918)
I (0.985)→
I (0.873)
I (0.994)→
I (0.917)
I (0.99)→
I (0.901)
I (0.989)→
I (0.894)
Site 571 440: N E (1.0)→
E (0.999)
E (1.0)→
E (0.999)
E (1.0)→
E (0.999)
E (1.0)→
E (0.999)
E (0.999)→
E (0.998)
E (0.999)→
E (0.998)
Site 572 441: A W (0.989)→
W (1.0)
W (0.993)→
W (1.0)
W (0.989)→
W (1.0)
W (0.993)→
W (1.0)
W (0.998)→
W (1.0)
W (0.998)→
W (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 573 442: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 574 443: K K (0.996)→
K (0.92)
K (0.998)→
K (0.955)
K (0.996)→
K (0.92)
K (0.998)→
K (0.954)
K (0.996)→
K (0.925)
K (0.996)→
K (0.925)
Site 575 444: D E (0.951)→
E (0.875)
E (0.943)→
E (0.863)
E (0.951)→
E (0.875)
E (0.944)→
E (0.864)
E (0.936)→
E (0.84)
E (0.937)→
E (0.841)
Site 576 445: S H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
H (1.0)→
H (1.0)
Site 579 446: P R (0.513)→
R (0.314)
R (0.593)→
R (0.354)
R (0.513)→
R (0.314)
R (0.587)→
R (0.352)
R (0.737)→
R (0.429)
R (0.707)→
R (0.401)
Site 580 447: E E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
E (1.0)→
E (1.0)
Site 581 448: L F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 582 449: K A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 583 450: I R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (0.999)
Site 584 451: A A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 585 452: L F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 586 453: E E (1.0)→
E (0.995)
E (1.0)→
E (0.994)
E (1.0)→
E (0.995)
E (1.0)→
E (0.994)
E (1.0)→
E (0.995)
E (1.0)→
E (0.995)
Site 587 454: T S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
S (1.0)→
S (1.0)
Site 588 455: W F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
F (1.0)→
F (1.0)
Site 589 456: K P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
P (1.0)→
P (1.0)
Site 590 457: E Q (0.92)→
Q (0.937)
Q (0.894)→
Q (0.919)
Q (0.92)→
Q (0.937)
Q (0.895)→
Q (0.92)
Q (0.913)→
Q (0.929)
Q (0.916)→
Q (0.931)
Site 591 458: I D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 592 459: K A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
A (1.0)→
A (1.0)
Site 593 none D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
D (1.0)→
D (1.0)
Site 594 none K (0.747)→
Q (0.581)
K (0.751)→
Q (0.505)
K (0.747)→
Q (0.581)
K (0.746)→
Q (0.506)
K (0.747)→
K (0.453)
K (0.742)→
K (0.45)
Site 595 none L (0.999)→
L (0.999)
L (0.999)→
L (1.0)
L (0.999)→
L (0.999)
L (0.999)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 596 none F (0.968)→
F (0.925)
F (0.974)→
F (0.939)
F (0.968)→
F (0.925)
F (0.975)→
F (0.94)
F (0.975)→
F (0.941)
F (0.975)→
F (0.941)
Site 597 none P (0.999)→
P (1.0)
P (0.999)→
P (1.0)
P (0.999)→
P (1.0)
P (0.999)→
P (1.0)
P (0.999)→
P (1.0)
P (0.999)→
P (1.0)
Site 598 none G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
G (1.0)→
G (1.0)
Site 599 none W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
W (1.0)→
W (1.0)
Site in msaprobs Site in A.Ac....GammaP PROTGAMMALG msaprobs PROTGAMMAWAG msaprobs PROTCATLG msaprobs PROTCATWAG msaprobs PROTGAMMAJTT msaprobs PROTCATJTT msaprobs
Site 600 none R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (1.0)
R (1.0)→
R (0.999)
R (1.0)→
R (0.999)
Site 601 460: F D (0.842)→
D (0.912)
D (0.812)→
D (0.886)
D (0.842)→
D (0.912)
D (0.816)→
D (0.888)
D (0.849)→
D (0.935)
D (0.851)→
D (0.936)
Site 610 468: L K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (1.0)
K (1.0)→
K (0.999)
K (1.0)→
K (0.999)
Site 612 469: D L (0.999)→
L (0.999)
L (1.0)→
L (1.0)
L (0.999)→
L (0.999)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
L (1.0)→
L (1.0)
Site 692 470: V G (0.99)→
G (0.551)
G (0.994)→
G (0.533)
G (0.99)→
G (0.551)
G (0.993)→
G (0.534)
G (0.992)→
G (0.652)
G (0.992)→
G (0.652)
Site 693 471: V V (0.975)→
P (0.37)
V (0.986)→
P (0.414)
V (0.975)→
P (0.37)
V (0.986)→
P (0.416)
V (0.97)→
P (0.339)
V (0.97)→
P (0.341)
Site 694 472: N H (0.976)→
H (0.967)
H (0.983)→
H (0.977)
H (0.976)→
H (0.967)
H (0.982)→
H (0.976)
H (0.969)→
H (0.96)
H (0.969)→
H (0.96)
Site 695 473: R K (0.554)→
A (0.369)
K (0.51)→
A (0.459)
K (0.554)→
A (0.369)
K (0.5)→
A (0.467)
K (0.415)→
A (0.422)
A (0.411)→
A (0.431)

Generated by PhyloBot at 10:29, February 18th 2020
Questions/Comments? help@phylobot.com